نشر كتاب مرجع انتشار آثار مرجع و پژوهشهاي حوزه دانش، فرهنگ و تمدن را در اولويت قرار داده و فَروَست كتابخانة دانشنامه جهان اسلام و كتاب طاووس (گروه كودك و نوجوان) دو زيرمجموعة آن است.
تلاش براي رفع كاستيهاي عرصة نشر در حوزة مرجع و جلب حمايت و توجه به آن، هدف اصلي اين واحد مؤسسة كتاب مرجع است كه اميد دارد با انتشار آثار تأليفي پيشگام و ترجمههاي دقيق از منابع مهم و ضروري، محقّق شود؛ و دستيابي به اين مهمّ، جز با راهنمايي و همراهي كارشناسان و اهل تحقيق ميسّر نيست.